Med den elektroniska bakluckan (finns som tillval) kan bagageutrymmet öppnas och stängas med en knapptryckning eller med en knapp på bilnyckeln. Den kan också öppnas med hjälp av den virtuella pedalen, alltså genom att flytta foten nära sensorn på den bakre stötfångaren, vilket gör att den öppnas automatiskt.

Det automatiska utdragbara skyddet täcker allt du har i bagageutrymmet. Den största fördelen visar sig när du vill lägga i eller ta ut något ur bagageutrymmet. Efter att bakluckan har öppnats skjuts locket automatiskt ett steg tillbaka vilket gör det smidigt för dig.

I typisk Škoda-anda erbjuder bagaget i Škoda Enyaq mycket praktiska funktioner. Föremål kan fästas i bagageutrymmet med hjälp av lastelement. Skjut bara dina lådor eller shoppingkassar mellan fästelementen så sitter de snart fast. Lastelementen kan fällas ihop och förvaras vid sidan av bagageutrymmet.

I bagageutrymmet på Enyaq finns det robusta krokar på sidorna. De är utformade för att hänga föremål eller bagage som annars skulle vara instabila eller inte passa på bagagegolvet.